MTs Yusuf Annur berkomitmen menyelenggarakan pendidikan bermutu melalui penerapan Sistem Manajemen Organisasi Pendidikan (Educational Organizations Management System/EOMS) ISO 21001:2018, sebagai upaya mewujudkan visi madrasah. Sebagai wujud komitmen tersebut, MTs Yusuf Annur menetapkan Kebijakan Mutu sebagai berikut:
- Menyelenggarakan pendidikan formal terintegrasi dengan pesantren yang berorientasi pada penguatan Al-Qur’an dan Sains, teknologi, serta nilai-nilai Islam rahmatan lil ‘alamin.
- Menerapkan dan memelihara Sistem Manajemen Mutu Pendidikan ISO 21001:2018 pada seluruh proses pendidikan dan layanan pendukung.
- Mengembangkan pendidikan dan pembelajaran holistik integratif yang seimbang antara iman, ilmu, dan amal sholeh berstandar nasional dan internasional.
- Meningkatkan prestasi akademik dan non-akademik melalui ekstrakurikuler, serta partisipasi aktif dalam kompetisi tingkat regional, nasional, dan internasional.
- Menumbuhkan dan membina akhlak mulia serta karakter Islami seluruh warga madrasah.
- Menguatkkan wawasan global dengan bahasa Arab dan Inggris serta optimalisasi pembelajaran dengan pendekatan saintifik.
- Mengembangkan SDM profesional berkualifikasi sesuai standar nasional dan/atau internasional, profesional, berdaya juang tinggi, serta berbudaya belajar abad ke-21.
- Menyediakan lingkungan belajar yang aman, nyaman, bersih, sehat, dan ramah anak.
- Mengembangkan budaya lingkungan hidup melalui pembelajaran berbasis lingkungan, peningkatan kompetensi SDM PLH, penghematan sumber daya, penerapan prinsip 5R (Ringkas, Rapi, Resik, Rajin, Rawat), serta menuju standar Madrasah Adiwiyata.
- Membangun kemitraan strategis nasional dan internasional.
Kebijakan Mutu ini dikomunikasikan, dipahami, dan diterapkan oleh seluruh warga madrasah serta ditinjau secara berkala untuk memastikan kesesuaian dengan arah strategis MTs YusufAnnur dan tuntutan perkembangan zaman.